FUNCATRA es una entidad que pertenece al sector público que se rige por la legislación autonómica específica en materia de fundaciones y de forma supletoria por la legislación estatal, así como por el ordenamiento jurídico privado, salvo en las materias en que le sea de aplicación la normativa presupuestaria, contable, de control económico-financiero y de contratación del sector público.
Por tanto, es diversa la legislación que es de aplicación a FUNCATRA: